 |
Bacterie ID met PCR |
|
|
Bacterie ID met PCR |
|
Inleiding � Taak � Proces � Bronnen � Beoordeling � Conclusie
Een toepassing van de PCR is het sequensen van onbekend DNA, dat wil zeggen dat onbekend DNA met PCR wordt vermeerderd waarna de basenvolgorde (code) wordt bepaald. Deze bepaling van de basenvolgorde wordt DNA sequencing genoemd. De code van de onbekende bacterie wordt met de computer vergeleken met de codes van heel veel verschillende bekende bacteriestammen (database).
Vind je de overeenkomstige code dan weet je met welke bacterie je te maken hebt: de identiteit is bekend, de bacterie ge�dentificeerd.
De handelingen uit het laboratorium kun je in deze opdracht virtueel - op het beeldscherm - uitvoeren.
Je gaat virtueel een onbekende bacteri�n identificeren met de PCR-techniek en brengt hiervan verslag uit.
Ga naar de site BioInteractive, klik op Bacterial ID Lab en �treedt� het DNA-laboratorium binnen. Voer in dit virtuele laboratorium de bacterie identificatie stap voor stap uit.
Maak tijdens de bepaling van elke stap aantekeningen: wat doe ik en waarom?
De achtergrond van de bepalingen staat in het rechterscherm beschreven.
Een nadere uitleg van DNA-sequencen kan echter geen kwaad, dus als je hulp nodig hebt voor het DNA-sequencen ga dan naar de tweede hieronder genoemde bron.
Maak na afloop van je bepaling een verslag met:
- Doel
- Beknopte uitleg van de verschillende stappen
- Een uitgebreide uitleg van de DNA sequencing in eigen woorden.
- De controles
- Conclusie: print hiertoe ook de resultaten en de conclusie van de DNA databank uit.
Bespreek het verslag met je medestudenten en je docent.
In de bespreking moet duidelijk worden dat je de bepaling begrepen hebt.
- BioInteractive, een site met virtuele Laboratoriumproeven, onder Bacterial ID Lab (ID is de afkorting van identify). Klik op het Bacterial ID Lab en je gaat het DNA sequencing lab binnen.
- DNA-sequencen, een site met veel afbeeldingen waar de plaatjes alleen al heel veel duidelijk uitleggen, een goede aanvulling op de virtuele bepaling, wordt al het Engels je wat te veel klik dan hier voor een vertaling:
- DNA sequencing (Nederlandstalig)
Het verslag wordt ingeleverd en besproken met medestudenten en/of de docent.
Bij de beoordeling wordt gelet op de volgende punten:
- Het op tijd afhebben van het verslag
- Een duidelijke, boeiende presentatie
- Deelname aan de discussie tijdens de bespreking
- Het verslag:
- Een juiste stapsgewijze uitleg van de virtuele bepaling
- Duidelijke tekst (zonder taalfouten)
- Een print van de uitslag en conclusie
Als je deze opdracht hebt uitgevoerd weet je wat DNA sequencing inhoudt en hoe hiermee identificatie mogelijk is.
Ook weet je hoe een geautomatiseerde DNA-sequencing in zijn werk gaat.
Je begrijpt de geautomatiseerde apparatuur en je weet hoe de uitslagen met behulp van een database tot een identificatie leiden.
Je hebt een aantal Engelstalige begrippen geleerd, die ook veel op Nederlandse laboratoria gebruikt worden.
Nog een webquest doen?
Surf naar www.webkwestie.nl
Heeft u op- of aanmerkingen ter verbetering van deze webquest?
Zijn er internetlinks die niet werken?
Geeft het even door. Klik daarvoor
hier.